歷史沿革：
民國76年政府宣布解除軍事戒嚴，於該戒嚴時期交由軍管之國境警察業務，依法回歸由內政部警政署掌理，復基於國內政治情勢變化與實際工作需求乃於中央警官學校於民國79年成立國境警察學系，以培育我國國境執法之優秀幹部。
民國100年本系應移民署需要，開始招收移民事務組學生。現國境警察學系分有兩組，一為「國境管理組」，畢業後參加國境警察特考，及格後赴警察相關機關擔任國境警察工作；另一為「移民事務組」，畢業後參加移民特考，及格後赴移民相關機關擔負移民有關業務。
鑑於安全環境之變遷，維護國家安全相關之移民署、警政署等任務發展需求，本系於民國93年，於本校外事警察研究所下增設「國境警察組」以因應國境執法人才之需求。在積極申請獨立設所下，終於104年10月21日完成「國境警察學系碩士班」成立揭牌，且於105學年度起開始獨立招生。

系所特色：
21世紀之快速全球化與科技發展，為「人流」與「物流」帶來便利但也帶來新威脅。攸關國家安全之包括港口、海岸人員、貨品、船舶、航空機等交通工具入出國、海岸巡防及安全檢查業務等在內之「國境管理」日趨重要。移民輔導、外籍人士入出國、停居留管理，永久居留問題亦日益複雜；刑事司法互助、國際毒品與非法槍械走私、非法移民與人口販運、恐怖主義等非傳統安全威脅等之跨國（境）犯罪問題更形突出。國境警察學系研究特色如下:
一、 國境執法：國境警察之理論與實務，各國有關機場、港口安全檢查、海岸巡防之法律與制度，跨國（境）犯罪與國際刑事司法之互助，兩岸關係法制與安全實務等相關研究。
二、 國土安全：國安機制與國土安全之理論與實務，國境安全管理政策與實務，警察危機管理之理論與實踐，威脅鑑定與弱點評估方法學等相關研究。
三、 跨國(境)犯罪(含反恐研究)：跨國（境）犯罪理論與實務、跨國組織犯罪理論與執法、國際恐怖主義之理論與實務，反恐警察學之發展與實踐、恐怖活動與組織性犯罪，恐怖組織分析及恐怖活動反制措施等相關研究。
四、 人口移動：人口移動之理論與實務，各國入出國管理與國境執法之法律與制度，各國之國籍制度、入出國境證照查驗及難民管理制度，國際移民與面談機制及移民輔導與照顧等相關研究。

系所目標
為培養現代國境警察之專門人才，提昇國境警察之研究發展，本系教師除致力於提升教學品質外，於寒暑假期間亦赴實務機關考察蒐集相關資料，每學期並安排多場學者、專家專題演講，且每年皆舉辦國境警察學術研討會，俾利學術及警察實務之結合。同時亦接受國科會及相關行政機關之委託，致力專案研究，為國境警察學術研究開啟新契機。系所教育之主要目標有：
1.培育具備敏覺能力之國境安全與管理案件預防及執法專業人才；
2.培育具備縝密思維能力之國境情報蒐集、研析專業人才；
3.培育具備科學精神之國境安全與管理政策分析與執法專業人才；
4.培育具備宏觀視野之國際警察合作方案規劃與執行專業人才；
5.提昇國境安全管理與國境執法領域學術研究水準。